středa 15. prosince 2010

M - Posloupnost 04 Dú: (Aritmetická, geometrická)

Bio - všechno co jste chtěli vědet o genetice a báli jste se zeptat


Genetika
genetika = nauka o dědičnosti a proměnlivosti organismů
dědičnost = schopnost organismů uchovávat soubory genetických informací a předávat je svým potomkům
zabezpečuje stálost druhu
způsobuje podobnost a rozmanitost
proměnlivost = schopnost org. měnit vlastnosti, máme ji díky adaptaci org. v určitém prostředí
vloha = gen, informace pro utvoření určité vlastnosti org., je to biochemický znak
gen = úsek DNA, nese informaci o tvorbě bílkovin
bílkovina = stavební látka
enzym = řídí průběh metabolismu
lokus = úsek DNA, který obsahuje jen jeden gen, určení lokusů jednotlivých genů vznikne chromozomová mapa
alela = je konkrétní forma genu, gen může mít jednu nebo více alel

Molekulární základy dědičnosti

Nukleonové kyseliny

molekuly nukleonových kyselin = nositelé genetické informace
tvořeny řetězci vzájemné spojených nukleotidů
jsou složkou prakticky všech buněk
objeveny r. 1868, izolovány koncem 19. století
struktura objasněna r. 1953 Watsonem a Crickem, 1962 Nobelova cena
2 základní typy nukleových kyselin:
a) kyselina deoxyribonukleová (DNA) = obsažena v jádrech všech eukaryotických buněk
(u prokaryotických volně v cytoplazmě)
základní genetický materiál většiny organismů
slouží k uchování genetické informace
b) kyselina ribonukleová (RNA) = zajišťuje přenos genetické informace z DNA do struktury bílkovin
v organismech je přítomna v několika typech:
1) m-RNA (mediátorová RNA) = obsahuje přepis informací z DNA o primární struktuře bílkovinné molekuly, je matricí pro syntézu (vzorem) bílkovin
nachází se v chromozomu
2) r-RNA (ribozomová RNA) = součástí ribozomů, v nichž probíhá proteosyntéza
3) t-RNA (transferová RNA) = přenáší aminokyseliny z cytoplazmy na místo syntézy bílkovin (ribozomy), kde jsou spojovány do polypeptických řetězců
pro každou aminokyselinu existuje alespoň jedna t-RNA
odlišnost DNA a RNA
a) liší se přítomností cukerné složky
DNA: 2-deoxy-D-ribóza
RNA: D-ribóza

b) dusíkatými bázemi
DNA: thymin
RNA: uracil
nukleotid = základní stavební jednotka makromolekulárních nukleových kyselin
složení nukleotidu:
a) cukerná složka = pentóza (monosacharid s 5 uhlíky)
b) dusíkatá báze = navázána na cukernou složku
existují 4 typy (podle nich rozlišujeme 4 typy nukleotidů):
1) adenin (A)
2) guanin (G)
3) cytosin (C)
4) thymin (T) … pouze v DNA
5) uracil (U) … pouze v RNA
c) zbytek kyseliny trihydrogenfosforečné = jejím prostřednictvím jsou navázány jednotlivé nukleotidy

primární struktura NK = pořadí jednotlivých nukleotidů spojených v polynukleotidový řetězec
určuje genetickou informaci organismu
sekundární struktura NK = dána prostorovým uspořádáním polynukleového řetězce

molekula DNA – tvořena 2 polynukleotidovými řetězci (je dvouvláknová) stočenými do dvoušroubovice
spojení mezi vlákny dvoušroubovice DNA je realizováno vodíkovými vazbami mezi bázemi obou řetězců
k vazbě mezi určitou dvojicí bází dochází na základě komplementarity
molekula RNA – tvořena 1 polynukleovým řetězcem (je jednovláknová)
komplementární báze = vzniká mezi nimi vazba:
a) cytosin + adenin … C+A
b) adenin + thymin nebo uracilem … A+T (u DNA) nebo U (u RNA)
pořadí nukleotidů v jednom řetězci přímo určuje primární strukturu druhého řetězce (jeho matrici)
adenin a guanin = purinové báze, odvozené od purinu (2 kondenzované cykly)
spojeny 2 vodíkovými vazbami
cytosin, thymin a uracil = pyrimidinové báze, od pirimidinu (6členný, 2heteroatomy)
C + G spojeny 3 vodíkovými vazbami

Genetický kód

genetická informace = zapsaná ve struktuře DNA jako sled 4 typů nukleotidů (A, U, G, C)
každá z 20 proteinogenních aminokyselin (ze kterých se v b. tvoří bílkoviny) je kódovaná kombinací 3 po sobě následujících bází (nukleotidů)
začlenění každé aminokyseliny do vznikajícího polypeptidu je tedy určeno vždy trojicí = tripletem nukleotidů, které nazýváme kodony
genetický kód = soustava biologicky podmíněných pravidel, podle kterých jsou k jednotlivým kodonům přiřazovány určitě proteinogenní aminokyseliny
pořadí nukleotidů v NK tak řídí pořadí aminokyselin v molekule bílkoviny
v molekule NK jsou 4 typy nukleotidů, jejichž vzájemnými kombinacemi může vzniknout 64 (4na3) různých kodonů, pro něž platí:
1.) každý triplet kóduje jen 1 aminokyselinu
2.) genetický kód je degenerovaný = tzn. stejná aminokyselina může být kódována i několika různými triplety (64 tripletů, 20 proteinogenních aminokyselin)
3.) genetický kód je univerzální = tzn. u všech org. mají jednotlivé kodóny tentýž kódovací smysl

terminační kodony (UAA, UAG, UGA) = nekódují aminokyselinu, zakončují řetězec polypetidu

iniciační kodony (AUG) = začíná řetězec

Přenos genetické informace

přenos gen. inf. z mateřských b. do dceřiných je umožněn schopností DNA se replikovat a tvořit dceřiné molekuly, které jsou předávány do dceřiných b. pro mitotickém dělení
exprese genu = vyjádření gen. inf. proteosyntézou (syntézou bílkovin), tzn. vyjádření primární struktuře bílkovin
proteosyntéza probíhá ve 2 stupních:
1) transkripce = inf. z DNA se přepíše do m-RNA
probíhá především v buň. jádře, ale i v organelách, kt. obsahují DNA (např. mitochondrie)
2) translace = podle inf. v m-RNA se syntetizují bílkoviny, probíhá na ribozomech
pořadí aminokyselin v polypeptidovém řetězci je určeno pořadím nukleotidů v m-RNA

I.) replikace DNA

= vznikají z 1 molekuly DNA 2 strukturně shodné molekuly dceřiné
= z původní molekuly DNA vznikají 2 dvouř. dceřiné molekuly, ve kt. 1 ř. pochází z původní mateřské molekuly DNA a druhá je nově vytvořená
základním enzymem nutným pro replikaci DNA je DNA-polymeráza = katalyzuje tvorbu vazeb mezi nukleotidy
k replikaci DNA dochází v tzv. S (syntetické) fázi mitotického dělení
a) rozvinutí a uvolnění jednotlivých řetězců šroubovice DNA, zanikají H vazby mezi bázemi nukleotidů
b) polynukleotidové ř. slouží jako vzory (matrice), ke kt. se na základě komplementarity přiřazují volné nukleotidy
c) jednotlivé nukleotidy se mezi sebou spojují vazbami a vytvoří nový polynukleotidový ř., jehož pořadí nukleotidů je komplementárně určeno pořadím nukleotidů v matricovém ř.


Př.1:
DNA: CACCGTACAG
DNA: GTGGCATGTC
Př.2:
DNA: AGA CAA CGA
RNA: UCU GUU GCU
Př.3:
Jeden z řetězců DNA má tyto nukleotidy. Jaké je pořadí nukleotidů v úseku řetězce?
AGT A C C G A T – mateřská buňka
TCA T G G C T A – dceřiná buňka

II.) transkripce DNA

= přepis gen. inf. z DNA do m-RNA
katalyzátor reakce = RNA-polymeráza
a) nejprve dochází k rozvolnění dvoušroubovice DNA
b) 1 ř. DNA slouží jako matrice, k jednotlivým nukleotidům DNA (=deoxyribonukleotidy) se na základě komplementarity přiřazují volné nukleotidy RNA (=ribonukleotidy)
c) nukleotidy RNA jsou spojeny vazbami a vytvoří souvislý polyribonukleotidový ř., kt. se prodlužuje a postupně se od molekuly DNA odděluje, opouští jádro a napojuje se na ribozomy
(na rozdíl od replikace se při transkripci páruje adenin z DNA s uracilem z RNA (A+U)
DNA: A+T
mRNA: A+U

III.) translace

= překlad gen. inf. z pořadí nukleotidů v m-RNA do pořadí aminokyselin v polypeptidickém ř. prostřednictvím gen. kódu
proces syntézy bílkovin podle inf. obsažené v molekulách m-RNA
aminokyseliny jsou na místo syntézy (do ribozomů) transportovány pomocí
t-RNA
druh aminokyseliny určuje kodon (=triplet) = 3 za sebou následující báze v m-RNA
ke každému kodonu je komplementární antikodon
každá t-RNA je specifická pro určitou aminokyselinu
fáze translace:
a) m-RNA opustí jádro a dostane se do kontaktu s ribozomy v cytoplazmě
b) na ribozomu se k jednotlivým kodonům připojí antikodony molekuly t-RNA a na ribozomech se seřazují aminokyseliny do pořadí určené pořadím v m-RNA
c) vytvoří se bílkovina

Př.1:
DNA: CAC
replikace: GTG
transkripce: CAC
translace: GUG

Př.2:
DNA: CGT
replikace: GCA
transkripce: CGU
translace: GCA


M - Posloupnost 03 (Aritmetická, geometrická)